《法证先锋3粤语版》在香港前往菲律宾的客机上一对恩爱度蜜月的新人、三个好友与一对神经质的夫妻、一个快递员共赴菲律宾旅游却遇到了连串怪事快递员过关时被扣下发现自己运送的是一坛骨灰神经质夫妻一入酒店就被吓了出来恩爱夫妻遇到一位女巫寓言丈夫将会不忠并生有一子三个好友偶遇一当地美女前往镇上舞会却是不幸入魔窟John Stonemap教授任教于当地的大学他做人的宗旨是不能用暴力解决一切的问题有一天他怀孕的妻子被街上的小阿飞袭击John忍无可忍竟错手杀死了他这件事被一个专门非法播放拳击比赛的富翁知道此后阿John的生活便彻底改变了富翁的手下抓住了阿John并把他关在北极的一间小屋子里比赛就在这里进行因此阿John无法逃避在他的第一轮比赛里他不肯杀死他的对手但为了妻子的生命他会因此而改变生意吗文、杰(郑伊健饰)是一对孪生兄弟由于父母离婚文便留在香港与母亲生活杰则随父亲移居泰国20多年后杰回港探望弟弟竟遇上了交通意外杰致人死亡外更令自己暂时半身不遂杰用的是文的驾驶执照因此身份调换了杰的女友珍(蔡卓妍饰)急急找杰回泰国完成一桩交易文只好代替哥哥前往原来杰欠下了当地黑帮老大一笔债款珍和文为了尽快解决事情竟然惹出了更多的事端兄弟两人在调换身份期间发现原来自己从来没有珍惜过身边的人启发甚多杰康复回到泰国又能否解决所有事端呢?尚恩在另一个对比的地球担任重案刑警不同的是那里的科技全都倚靠魔法运作 一次他着手调查一连串怪异谋杀案犯案手法都是他过去从来未见因为凭借是科学他在雷诺一名崇尚科学更甚于传说和童话的「实用主义」忠实成员以及 130岁的魔法师丘吉尔这两人的协助下发现层层迂回的内幕引领他来到另一个时空也就是我们存在的地球这时他才发现如果他不出手阻止两个地球都 会面临毁灭...