《三夜落红》动画的故事舞台设定在现代的涩谷之中主角织田龙平在小学时目击过憧憬的哥哥的神秘死亡现场现在是高中生的他早已摆脱了当时的恶梦和平常一样练着拳击的某天晚上他被奇怪的生物咬了一口坠入了一个和平常不少女本来与家人幸福地生活在村子里然而山上的恶魔下来杀了她的父亲母亲也被强暴而死幼年的她被一个过路的忍者剑客收养两人在公寓里单独相处,呆了约有两小时之久随后,陈思诚与女孩一同走出公寓大门记者看到,这位素颜的女孩容貌姣好,气质清新,戴着黑框眼镜,...16岁的少年三栗智和在某个夜晚做了个奇怪的梦在这个未曾见过的梦世界里看到一个少女在和敌人战斗在那个梦世界智和有着不可思议的力量并给予少女那个力量来击退敌人智和就在这种迷惑下醒来并且感到吃惊我的床直到白馬王子咚咚來一個「擦槍走火」從此引發好姊妹之間戰火當整個小鎮與我為敵 任职大学教授的俊荣(甘宇成饰)一向崇尚有性无爱认为结婚只是一种守旧及无谓的制度他认识了性感开放的灯饰设计师娟姬(严正花饰)两人首次约会便发生了第一次关系思想开放的娟姬毫不介意这个只求恋爱不求故事发生在一所名叫第3新东京世立NERV学园中校长是严肃又寡言的碇原度(立木文彦配音)作为校长的儿子碇真嗣(绪方惠美配音)感到压力很大于此同时来自外国的红发转学生明日香(宫村优子配音)分裂...