《三只眼》“军队罪行调查部”的高级官员布伦纳(约翰·特拉沃夫塔 John Travolta 饰)和其助手森希尔(马德琳·斯托 Madeleine Stowe 饰)奉命36小时内调查清楚一起神秘的谋杀案副总统的有力竞争者坎贝尔将军(詹姆斯·克伦威尔 James Cromwell 饰 )的女儿伊丽莎白(莱斯利·斯蒂芬森 Leslie Stefanson 饰)在军事基地内被残忍杀害随着调查深入布伦纳发现曾就读于西点军校的伊丽莎白除了成绩优异、长相出众外在高中时还发生过一起不为人知的事情她的私生活糜烂不堪与父亲的关系并不融洽而坎贝尔将军也不像他所塑造的形象一样刚正不阿在揭开事情真相的同时布伦纳也发现了许多军队中的秘密最终杀人凶手被惩治以法事件得以平息北方某城的居民区发生了一起母亲打死儿子的惨案女工李梦秋因儿子陈晓飞在统考中未得满分隐瞒了成绩气愤地毒打儿子至死晓飞有个叫叶波的同学他的母亲袁冰怡接手了李的案子通过调查和访谈袁了解到了李打死儿子的动因和真相:李是个勤劳善良的刚强女人她爱儿子希望儿子能出人头但李所处的社会地位使她将改变自身命运的希望寄托在了儿子身上一旦儿子出现闪失过分的爱就变成了极端的恨将儿子误伤至死亚瑟深知反派的残暴最终一定不会放过自己在成功暗杀了两个目标之后亚瑟和第三个目标——另一支规模庞大的军火商头目亚当斯(汤米·李·琼斯饰)结成同盟一同对付他们共同的对手那么亚瑟最终能否和吉娜一起逃脱平静的生活能否再继续……...